Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms