Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trem1Q9JKE2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms