Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms