Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tspan4Q9DCK3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tspan4Q9DCK3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tspan4Q9DCK3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tspan4Q9DCK3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tspan4Q9DCK3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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