Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 2900076A07Rik-203ENSMUST00000180879 725 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm35501-202ENSMUST00000215101 459 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm40638-201ENSMUST00000216422 682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tspan6-201ENSMUST00000087557 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm27195-201ENSMUST00000184283 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms