Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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