Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pdzd9Q9D9M4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pdzd9Q9D9M4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms