Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms