Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Trmt44Q9D2Q2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trmt44Q9D2Q2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms