Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pin4Q9CWW6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pin4Q9CWW6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms