Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms