Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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