Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms