Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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CsprsQ99388 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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CsprsQ99388 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CsprsQ99388 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CsprsQ99388 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 930.1 ms