Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms