Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl3Q91YH5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms