Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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