Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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