Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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