Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntrobQ8CB62 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms