Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4933409G03RikQ8C5U0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms