Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms