Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms