Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Nop53Q8BK35 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop53Q8BK35 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms