Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Clrn3Q8BHH8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Clrn3Q8BHH8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms