Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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