Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc155Q80VJ8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms