Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms