Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtifQ6PEE2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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