Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms