Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bend3Q6PAL0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms