Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Sbno1Q689Z5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Sbno1Q689Z5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno1Q689Z5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sbno1Q689Z5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sbno1Q689Z5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sbno1Q689Z5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Sbno1Q689Z5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Sbno1Q689Z5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Sbno1Q689Z5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Sbno1Q689Z5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sbno1Q689Z5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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