Protein–RNA interactions for Protein: Q684R7

Frem1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem1Q684R7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Frem1Q684R7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Frem1Q684R7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms