Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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