Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BcanQ61361 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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BcanQ61361 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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