Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln3Q61124 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms