Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ctf1Q60753 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctf1Q60753 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms