Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms