Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms