Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne3Q4FZC9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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