Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc185Q3V118 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc185Q3V118 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc185Q3V118 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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