Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem253Q3UNB8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmem253Q3UNB8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmem253Q3UNB8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmem253Q3UNB8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmem253Q3UNB8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmem253Q3UNB8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmem253Q3UNB8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem253Q3UNB8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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