Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms