Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Spatc1Q148B6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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