Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MestQ07646 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms