Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms