Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top1Q04750 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms