Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms