Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms