Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RhobP62746 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms